Modificaciones clave de proteínas, como la glicosilación y la fosforilación, regulan una variedad de procesos celulares, incluido el reconocimiento célula-célula, la respuesta inmune y el crecimiento celular. La desregulación de estas etiquetas está relacionada con las enfermedades humanas, lo que las hace importantes para estudiar la progresión de la enfermedad e identificar biomarcadores y objetivos farmacológicos mediante espectrometría de masas. Sin embargo, dado que estas modificaciones suelen ser poco abundantes y cambian dinámicamente, primero deben enriquecerse. A pesar de los avances en el desarrollo de estrategias de enriquecimiento individuales, los científicos aún tienen que desarrollar una plataforma robusta y altamente sensible para abordar múltiples modificaciones simultáneamente.
El equipo de Yu-Ju Chen de Taiwán publicó un artículo en el Proteómica molecular y celular introduciendo una estrategia de enriquecimiento simplificada llamada Fe-ZIC-cHILIC, que captura tanto glicopéptidos, o GP, como fosfopéptidos, o PP, en un solo paso. Este método utiliza una punta en tándem empaquetada con un material especial que combina iones de hierro con resina ZIC-chilic. En esta configuración, la muestra fluye a través de esta punta en tándem, minimizando la pérdida de proteínas y enriqueciendo los GP en la punta superior mientras que los PP están en la punta inferior. Utilizando esta estrategia, analizaron células de cáncer de pulmón de células no pequeñas o células de NSCLC con mutaciones en el EGFR gen, que es la terapia dirigida de primera línea, pero que en última instancia genera resistencia a los medicamentos y conduce a la recurrencia del tumor. Dentro de un solo tipo de célula, identificaron 10.536 GP y 11.329 PP y encontraron cambios significativos en los glicopéptidos y fosfopéptidos específicos del sitio entre las células sensibles y resistentes a los medicamentos. En particular, observaron cambios en las proteínas de la familia EGFR, ERBB2, MET e integrinas, que son objetivos principales para los tratamientos contra el cáncer.
Este estudio destaca tanto la novedad del material Fe-ZIC-chHILIC en enriquecimiento dual con alta especificidad para estudiar modificaciones de proteínas. Investigaciones futuras evaluarán la estrategia en diferentes tipos de muestras para determinar cómo estas modificaciones impulsan la resistencia y cómo se podrían desarrollar terapias para mejorar los resultados.
